Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB7P09629 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB7P09629 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms