Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSP90AB1P08238 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HSP90AB1P08238 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms