Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEFMP07197 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEFMP07197 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEFMP07197 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEFMP07197 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEFMP07197 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEFMP07197 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEFMP07197 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms