Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3DP05423 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms