Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPRP00739 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPRP00739 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPRP00739 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPRP00739 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPRP00739 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPRP00739 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPRP00739 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPRP00739 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms