Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG12O94817 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATG12O94817 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG12O94817 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms