Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC45O75419 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC45O75419 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC45O75419 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC45O75419 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC45O75419 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC45O75419 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC45O75419 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC45O75419 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC45O75419 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC45O75419 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms