Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNC1O60486 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNC1O60486 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNC1O60486 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNC1O60486 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNC1O60486 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNC1O60486 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNC1O60486 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms