Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMARCA5O60264 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCA5O60264 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms