Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DUX1O43812 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DUX1O43812 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DUX1O43812 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUX1O43812 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX1O43812 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX1O43812 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUX1O43812 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms