Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYNGR3O43761 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms