Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms