Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPAA1O43292 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms