Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MEFVO15553 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MEFVO15553 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms