Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARPC5O15511 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms