Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD1AO15047 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETD1AO15047 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms