Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP2O14595 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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