Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BHLHE40O14503 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms