Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms