Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PMD0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PMD0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PMD0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PMD0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PMD0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms