Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3BA8MYP8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms