Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALM3A6NDB9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PALM3A6NDB9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms