Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM149AA5PLN7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM149AA5PLN7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM149AA5PLN7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM149AA5PLN7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM149AA5PLN7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM149AA5PLN7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM149AA5PLN7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM149AA5PLN7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM149AA5PLN7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM149AA5PLN7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms