Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F8A0AVK6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms