Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM3AP98173 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms