Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP002761.1-201ENST00000400985 262 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNRPGP11-201ENST00000411777 232 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC00545-201ENST00000440633 411 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP1B1P1-202ENST00000448124 191 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PGAM4-201ENST00000458128 765 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SL573P-201ENST00000485340 276 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 OR10J2P-201ENST00000514684 961 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC106774.1-201ENST00000515105 321 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC009927.2-201ENST00000520812 481 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 GSTZ1-216ENST00000556627 919 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 VN1R67P-201ENST00000568379 913 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL031772.1-216ENST00000619494 697 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MIR6742-201ENST00000622338 62 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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