Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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