Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TM6SF1Q9BZW5 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TM6SF1Q9BZW5 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TM6SF1Q9BZW5 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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TM6SF1Q9BZW5 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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TM6SF1Q9BZW5 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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TM6SF1Q9BZW5 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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