Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms