Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RUNX2Q13950 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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