| RUNX2 | Q13950 | RDM1-215 | ENST00000612980 | 501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6780A-201 | ENST00000615089 | 68 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC131238.1-201 | ENST00000617135 | 328 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KLRF1-207 | ENST00000617793 | 1096 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR7703-201 | ENST00000620784 | 77 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000676.3-201 | ENST00000623299 | 569 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U3.53-201 | ENST00000628922 | 216 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068620.4-201 | ENST00000636730 | 1182 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CNTN5-212 | ENST00000619298 | 5734 nt | TSL 5 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FCHO2-207 | ENST00000512348 | 2700 nt | TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAB23-201 | ENST00000317483 | 2546 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC10A5P1-201 | ENST00000379063 | 1306 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATXN3-207 | ENST00000503767 | 1315 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EMSY-204 | ENST00000524490 | 4015 nt | TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CD84-206 | ENST00000368054 | 8181 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RALGAPA1-204 | ENST00000553892 | 6271 nt | TSL 5 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RAPGEF6-201 | ENST00000296859 | 5618 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P31-201 | ENST00000419366 | 1374 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C6-201 | ENST00000263413 | 3661 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CRISP3-201 | ENST00000263045 | 2170 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025125.1-201 | ENST00000624743 | 1922 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP44-201 | ENST00000258499 | 4022 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYLD-212 | ENST00000568704 | 3292 nt | TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTRNR2L7-201 | ENST00000544824 | 1535 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR56B2P-201 | ENST00000317102 | 954 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR1A2-201 | ENST00000381951 | 930 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-444P-201 | ENST00000383988 | 108 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068533.2-201 | ENST00000411872 | 306 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PTP4A1P5-201 | ENST00000420305 | 455 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012519.1-201 | ENST00000424588 | 610 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYP1B1-AS1-202 | ENST00000427168 | 484 nt | TSL 4 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SKP1P3-201 | ENST00000429280 | 487 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC119800.1-201 | ENST00000429871 | 423 nt | TSL 2 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2V1P1-201 | ENST00000430836 | 445 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL034418.1-201 | ENST00000448675 | 860 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104978.1-201 | ENST00000449387 | 391 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNAP25-AS1-204 | ENST00000451151 | 867 nt | TSL 2 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010307.1-201 | ENST00000467206 | 836 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104763.1-201 | ENST00000475274 | 360 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC073429.1-201 | ENST00000511749 | 503 nt | TSL 3 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007016.1-201 | ENST00000512110 | 244 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPS33P3-201 | ENST00000513456 | 322 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA48.10-201 | ENST00000516965 | 160 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108515.1-201 | ENST00000517407 | 525 nt | TSL 3 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NRG1-IT1-202 | ENST00000521463 | 742 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025437.3-201 | ENST00000523178 | 771 nt | TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CARD16-203 | ENST00000525374 | 503 nt | TSL 3 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000926.4-201 | ENST00000527351 | 454 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AHI1-212 | ENST00000528103 | 441 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000790.1-201 | ENST00000528891 | 737 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091053.2-201 | ENST00000534169 | 537 nt | TSL 4 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01486-201 | ENST00000538041 | 716 nt | TSL 2 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC095350.2-201 | ENST00000544034 | 201 nt | TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HIGD1AP17-201 | ENST00000554576 | 276 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAV15-201 | ENST00000556680 | 249 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC138915.2-201 | ENST00000569776 | 97 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC015912.2-201 | ENST00000571053 | 181 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090312.1-201 | ENST00000580637 | 348 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL690P-201 | ENST00000582087 | 240 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF682-204 | ENST00000593468 | 581 nt | TSL 4 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF66-203 | ENST00000594534 | 757 nt | TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL390838.2-201 | ENST00000602394 | 274 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104785.1-201 | ENST00000603220 | 588 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018638.7-201 | ENST00000605836 | 1114 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007308.1-201 | ENST00000608856 | 373 nt | TSL 3 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CNBD1-207 | ENST00000620844 | 876 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512506.2-201 | ENST00000624472 | 458 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC116618.1-201 | ENST00000634617 | 774 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109462.4-201 | ENST00000637882 | 581 nt | TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADGRL2-204 | ENST00000370715 | 5585 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LPAR6-209 | ENST00000620633 | 2175 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCNJ6-201 | ENST00000609713 | 19645 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL391684.1-202 | ENST00000641293 | 1636 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00550-201 | ENST00000629293 | 3434 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CENPE-208 | ENST00000611174 | 8260 nt | TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KIF15-203 | ENST00000425755 | 3460 nt | TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANK3-202 | ENST00000355288 | 3811 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C9orf72-203 | ENST00000380003 | 3200 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC135352.1-201 | ENST00000506173 | 1418 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ABI3BP-215 | ENST00000495063 | 3714 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF404-201 | ENST00000324394 | 1844 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001273.1-201 | ENST00000624493 | 3152 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KARSP3-201 | ENST00000571212 | 1504 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RABGAP1L-202 | ENST00000325589 | 1880 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCDH15-214 | ENST00000395446 | 3948 nt | TSL 5 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P28-201 | ENST00000438005 | 1594 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAP3K19-201 | ENST00000358371 | 3719 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IQGAP2-203 | ENST00000396234 | 3376 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ECM2-202 | ENST00000375540 | 1606 nt | TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021146.4-201 | ENST00000309229 | 279 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079741.1-201 | ENST00000321498 | 212 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-251P-201 | ENST00000363235 | 104 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.169-201 | ENST00000363745 | 96 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-115P-201 | ENST00000364310 | 107 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMLHE-202 | ENST00000369439 | 1248 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBBP2-201 | ENST00000376781 | 231 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-8-201 | ENST00000384365 | 95 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CASP3-203 | ENST00000393588 | 677 nt | TSL 4 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYB5AP4-201 | ENST00000396692 | 399 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATP5F1P3-201 | ENST00000397213 | 657 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |