Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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DDX39BQ13838 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
DDX39BQ13838 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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