Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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SEMA3BQ13214 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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SEMA3BQ13214 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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SEMA3BQ13214 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3BQ13214 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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