Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC45B-201ENST00000268876 5679 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf85-206ENST00000486911 3321 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1GAP2-203ENST00000540393 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF19-202ENST00000376257 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121L1P-202ENST00000605258 1835 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SUV39H1-201ENST00000337852 2978 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RIC3-201ENST00000309737 2859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GOSR2-237ENST00000640443 3929 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL4-201ENST00000319888 3601 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND2A-208ENST00000492720 3614 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP1A3-208ENST00000545399 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf94-202ENST00000488417 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNAB1-201ENST00000302490 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D8B-206ENST00000481617 4098 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MTSS1-205ENST00000518547 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX9-201ENST00000361487 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFBR1-209ENST00000552516 5933 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM92A-206ENST00000518322 4241 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAN-208ENST00000561243 7593 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNA2-207ENST00000638532 2426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms