Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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