Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 DRICH1-202ENST00000614553 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 GBA3-203ENST00000508166 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRHP20396 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms