Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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