Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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EHD3Q9NZN3 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
EHD3Q9NZN3 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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