Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PDK4Q16654 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms