Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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ATP1A4Q13733 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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ATP1A4Q13733 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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ATP1A4Q13733 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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ATP1A4Q13733 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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