Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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IFT88Q13099 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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