Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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