Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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