Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PAQR7-201ENST00000374296 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 USP53-201ENST00000274030 5936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007741.1-201ENST00000623818 3495 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R26P3-201ENST00000612861 3800 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TNC-201ENST00000341037 6786 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RD3-201ENST00000367002 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM1P35-201ENST00000501931 3188 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAF3IP3-205ENST00000400959 1854 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SAR1B-201ENST00000402673 6682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL7-201ENST00000007414 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 EXTL2-202ENST00000370114 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ETV1-206ENST00000405218 3391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-202ENST00000335762 6968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C19orf71-201ENST00000329493 674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 OBP2B-201ENST00000372032 702 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FCAR-207ENST00000391725 830 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PROSER3-203ENST00000421853 650 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL360181.2-201ENST00000424450 626 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BANF1P2-201ENST00000430526 264 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245036.4-201ENST00000432400 319 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IQCF4-204ENST00000433169 414 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX11L1-201ENST00000450305 632 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL683P-201ENST00000460552 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC034198.1-201ENST00000502828 202 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL672043.1-201ENST00000506599 395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108073.1-201ENST00000508231 674 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLC5-201ENST00000519670 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PKMP4-201ENST00000523134 306 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC120498.2-201ENST00000566997 249 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027688.1-201ENST00000568471 584 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4519-201ENST00000579767 58 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL431P-201ENST00000582918 305 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL296P-201ENST00000585237 299 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 COX6B2-207ENST00000589467 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SMCO4P1-201ENST00000592909 177 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.5 ms