Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 HNRNPA1P44-201ENST00000503999 879 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CAMK2BQ13554 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms