Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AFG3L2Q9Y4W6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AFG3L2Q9Y4W6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms