Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC3Q9UQE7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms