Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS5Q9UPZ3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS5Q9UPZ3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms