Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRAK1Q9UPV9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAK1Q9UPV9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms