Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF2Q9UNY4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms