Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NRXN1Q9ULB1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NRXN1Q9ULB1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms